Ο Σεμπαστιέν Ντεσάμπρ ξεκίνησε την προπονητική του καριέρα του σε συλλόγους της Αφρικής και της Μέσης Ανατολής, δουλεύοντας σε ομάδες όπως ΑΣΕΚ Μιμόζας, Εσπεράνς Τύνιδας και Γουιντάντ Καζαμπλάνκα. Στη συνέχεια ανέλαβε τις εθνικές Ουγκάντας και ΛΔ Κονγκό, ενώ είχε και πέρασμα από την Πιραμίντς και τη γαλλική Σαμουά Νιορτέ. Από το 2022 βρίσκεται στον πάγκο της Εθνικής Λαϊκής Δημοκρατίας Κονγκό.