O Τόμας Χούμποτσαν αγωνίζεται ως κεντρικός αμυντικός και ομάδα του είναι η Καρμιώτισσα. Στην Εθνική Σλοβακίας κλήθηκε για πρώτη φορά το 2006, ενώ έβαλε τέλος στην καριέρα του με το εθνόσημο το 2021, έχοντας καταγράψει συνολικά 73 συμμετοχές.