Σεμπάστιαν Κοάτες αγωνίζεται ως κεντρικός αμυντικός και ομάδα του είναι η Σπόρτινγκ Λισσαβώνας. Στην Εθνική Ουρουγουάης, της οποίας αποτελεί ενεργό μέλος, κλήθηκε για πρώτη φορά το 2011.