Ο Άλαν Μπενίτες ξεκίνησε την καριέρα του στη Λιμπερτάδ, ενώ στη συνέχεια αγωνίστηκε σε Ολίμπια, Σέρο Πορτένιο και Μινεσότα Γιουνάιτεντ. Ακολούθησε πέρασμα από την Ιντερνασιονάλ, πριν επιστρέψει το 2026 στη Λιμπερτάδ. Πρόκειται για έμπειρο παίκτη με μακρά πορεία σε Παραγουάη, Βραζιλία, Πορτογαλία και ΗΠΑ. Από το 2017 είναι διεθνής με την Εθνική Παραγουάης, με συμμετοχές σε υψηλό επίπεδο.