Ο Αγκουστίν Κανόμπιο ξεκίνησε την καριέρα του στη Φένιξ και καθιερώθηκε μέσω των εμφανίσεών του με την Πενιαρόλ. Στη συνέχεια έκανε το βήμα στη Βραζιλία για την Ατλέτικο Παραναένσε, όπου είχε γεμάτες και παραγωγικές σεζόν. Από το 2025 αγωνίζεται στη Φλουμινένσε, συνεχίζοντας σε υψηλό επίπεδο και διατηρώντας καλή παρουσία στο σκοράρισμα. Σε διεθνές επίπεδο αποτελεί από το 2022 μέλος της Εθνικής Ουρουγουάης.